15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1774 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  47.73 
 
 
181 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  44.57 
 
 
176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  41.61 
 
 
175 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  33.53 
 
 
189 aa  101  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  32.6 
 
 
178 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  32.35 
 
 
196 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  34.76 
 
 
163 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  28.39 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  35.33 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  27.87 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  33.01 
 
 
136 aa  48.5  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  29.6 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 
272 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>