21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2315 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2315  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2143  hypothetical protein  63.51 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000268028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2707  hypothetical protein  55.87 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2632  hypothetical protein  57.21 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000426447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2318  hypothetical protein  58.65 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2593  hypothetical protein  55.87 
 
 		 213 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1753  hypothetical protein  56.73 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000904353  hitchhiker  0.0017459 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2677  hypothetical protein  54.84 
 
 		 221 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0618791  normal  0.239313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1902  hypothetical protein  51.85 
 
 		 214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000136696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1945  hypothetical protein  55.29 
 
 		 222 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000111939  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2143  hypothetical protein  55.45 
 
 		 227 aa  247  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000288858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1990  hypothetical protein  52.58 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2343  hypothetical protein  53.05 
 
 		 213 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2271  hypothetical protein  53.05 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2461  hypothetical protein  52.11 
 
 		 213 aa  242  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2031  hypothetical protein  43.98 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000129168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1052  hypothetical protein  43.58 
 
 		 320 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1591  hypothetical protein  37.34 
 
 		 235 aa  167  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3534  hypothetical protein  32.57 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0202713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2931  hypothetical protein  37.62 
 
 		 324 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00108  putative orphan protein  24.11 
 
 		 209 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>