20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1990 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2461  hypothetical protein  84.51 
 
 		 213 aa  387  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2271  hypothetical protein  83.57 
 
 		 213 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2343  hypothetical protein  84.04 
 
 		 213 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2318  hypothetical protein  76.78 
 
 		 212 aa  351  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1753  hypothetical protein  76.42 
 
 		 213 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000904353  hitchhiker  0.0017459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2632  hypothetical protein  76.42 
 
 		 213 aa  344  7e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000426447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2593  hypothetical protein  75.94 
 
 		 213 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2707  hypothetical protein  75.94 
 
 		 213 aa  341  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1945  hypothetical protein  61.21 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000111939  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1902  hypothetical protein  56.87 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000136696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2677  hypothetical protein  58.69 
 
 		 221 aa  270  9e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0618791  normal  0.239313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2143  hypothetical protein  57.35 
 
 		 227 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000288858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2315  hypothetical protein  52.58 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2143  hypothetical protein  57.49 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000268028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2031  hypothetical protein  46.92 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000129168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1052  hypothetical protein  42.44 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3534  hypothetical protein  36.49 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0202713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1591  hypothetical protein  36.61 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2931  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  141  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>