20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2461 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2461  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012582  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2271  hypothetical protein  96.71 
 
 
213 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267798  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2343  hypothetical protein  95.77 
 
 
213 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1990  hypothetical protein  84.51 
 
 
214 aa  387  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2318  hypothetical protein  76.78 
 
 
212 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2707  hypothetical protein  77.73 
 
 
213 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100027  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1753  hypothetical protein  77.25 
 
 
213 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000904353  hitchhiker  0.0017459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2593  hypothetical protein  77.25 
 
 
213 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2632  hypothetical protein  76.78 
 
 
213 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000426447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1945  hypothetical protein  61.06 
 
 
222 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000111939  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1902  hypothetical protein  58.25 
 
 
214 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000136696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2677  hypothetical protein  58.22 
 
 
221 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0618791  normal  0.239313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2143  hypothetical protein  55.5 
 
 
227 aa  247  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000288858  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2143  hypothetical protein  57.97 
 
 
215 aa  245  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000268028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2315  hypothetical protein  52.11 
 
 
219 aa  242  3e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2031  hypothetical protein  46.38 
 
 
212 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000129168  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1052  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3534  hypothetical protein  39.15 
 
 
217 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0202713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1591  hypothetical protein  36.57 
 
 
235 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2931  hypothetical protein  34.16 
 
 
324 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>