20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2343 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2343  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  0.064653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2271  hypothetical protein  98.12 
 
 
213 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267798  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2461  hypothetical protein  95.77 
 
 
213 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012582  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1990  hypothetical protein  84.04 
 
 
214 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2318  hypothetical protein  76.78 
 
 
212 aa  353  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000153526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2707  hypothetical protein  78.57 
 
 
213 aa  352  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0100027  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1753  hypothetical protein  78.1 
 
 
213 aa  350  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000904353  hitchhiker  0.0017459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2593  hypothetical protein  78.1 
 
 
213 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2632  hypothetical protein  77.62 
 
 
213 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000426447  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1945  hypothetical protein  62.09 
 
 
222 aa  286  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000111939  normal  0.0117587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1902  hypothetical protein  59.71 
 
 
214 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000136696  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2677  hypothetical protein  60 
 
 
221 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0618791  normal  0.239313 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2143  hypothetical protein  56.94 
 
 
227 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000288858  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2143  hypothetical protein  58.45 
 
 
215 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000268028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2315  hypothetical protein  53.05 
 
 
219 aa  244  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2031  hypothetical protein  46.8 
 
 
212 aa  204  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000129168  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1052  hypothetical protein  40.28 
 
 
320 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3534  hypothetical protein  39.62 
 
 
217 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0202713 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1591  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2931  hypothetical protein  33.66 
 
 
324 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>