28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1778 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.459954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1812  hypothetical protein  77.04 
 
 		 198 aa  324  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00771142  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2654  hypothetical protein  77.04 
 
 		 198 aa  324  5e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2539  hypothetical protein  77.04 
 
 		 198 aa  324  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2532  hypothetical protein  76.53 
 
 		 198 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000860  hypothetical protein  75.13 
 
 		 199 aa  315  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000138514  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06835  hypothetical protein  74.62 
 
 		 199 aa  313  8e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0182  hypothetical protein  63.59 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  32.97 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  27.64 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  25.13 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  25.63 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  24.88 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  28.74 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  26.87 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  27.14 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1107  hypothetical protein  25 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  24.87 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  26.4 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  25.76 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2697  protein of unknown function DUF358  26.77 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0549  hypothetical protein  24.14 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  25.76 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  25.76 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  24.14 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  24.62 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  24.12 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  24.16 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>