28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2539 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1812  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00771142  normal  0.0163306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2539  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2654  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2532  hypothetical protein  99.49 
 
 
198 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1778  hypothetical protein  77.04 
 
 
198 aa  324  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.459954  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06835  hypothetical protein  70.71 
 
 
199 aa  298  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000860  hypothetical protein  70.71 
 
 
199 aa  296  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000138514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0182  hypothetical protein  66.15 
 
 
205 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0907  hypothetical protein  27.5 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000169556  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1107  hypothetical protein  24.24 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0171  hypothetical protein  25.74 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.190358  normal  0.933799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0217  hypothetical protein  23.27 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.638507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3229  hypothetical protein  26.9 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000502715  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1447  hypothetical protein  24.24 
 
 
199 aa  61.6  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353847  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0918  protein of unknown function DUF358  29.55 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000434231  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0731  hypothetical protein  25 
 
 
198 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.336545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1731  hypothetical protein  26.5 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1588  hypothetical protein  21.74 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1876  hypothetical protein  26.67 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.205093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0545  hypothetical protein  26.4 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0274885  normal  0.338347 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0669  hypothetical protein  24.39 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.239778  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0609  hypothetical protein  24.37 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0735  protein of unknown function DUF358  23.74 
 
 
199 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0549  hypothetical protein  24.14 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2697  protein of unknown function DUF358  24.75 
 
 
199 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3024  hypothetical protein  23.86 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1963  hypothetical protein  24 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1566  hypothetical protein  23.73 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.675454  hitchhiker  0.00439427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>