19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0056 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011092  SeSA_B0056  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.745833 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  44.3 
 
 		 405 aa  70.9  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  37.21 
 
 		 411 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 412 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 430 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  40 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 		 440 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  28.57 
 
 		 397 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25.97 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 415 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 439 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 439 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4757  major facilitator superfamily MFS_1, putative  31.82 
 
 		 429 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000635472  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  42.59 
 
 		 450 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 432 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  41.51 
 
 		 411 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  32.35 
 
 		 406 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 415 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>