23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0927 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0927  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0688121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0904  hypothetical protein  99.01 
 
 
302 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0872  hypothetical protein  98.68 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0813  hypothetical protein  98.01 
 
 
302 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0841  hypothetical protein  98.34 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.820957  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0325  uncharacterized membrane-anchored protein  40.55 
 
 
320 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116577  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5209  uncharacterized membrane-anchored protein  40.75 
 
 
317 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0652366 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2523  putative transmembrane protein  46.8 
 
 
303 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.034862  hitchhiker  0.0063146 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4682  uncharacterized membrane-anchored protein  40.75 
 
 
317 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4944  uncharacterized membrane-anchored protein  41.1 
 
 
339 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.0671583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5324  uncharacterized membrane-anchored protein  41.44 
 
 
339 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3042  uncharacterized membrane-anchored protein  41.44 
 
 
339 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07961  hypothetical protein  31.58 
 
 
314 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3256  putative uncharacterized membrane-anchored protein  32.28 
 
 
381 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4272  uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  31.72 
 
 
297 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2802  putative transmembrane protein  43.9 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3905  hypothetical protein  33.72 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1786  hypothetical protein  35.29 
 
 
348 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0312024  normal  0.982549 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1083  Uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  34.43 
 
 
335 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2467  hypothetical protein  33.2 
 
 
285 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206693  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3535  hypothetical protein  34.5 
 
 
330 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1534  hypothetical protein  30.98 
 
 
309 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451819  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1728  hypothetical protein  28.79 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000954712  normal  0.0885177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>