23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07961 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07961  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  634    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3256  putative uncharacterized membrane-anchored protein  48.57 
 
 
381 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3535  hypothetical protein  45.9 
 
 
330 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4272  uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  44.85 
 
 
297 aa  242  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1786  hypothetical protein  42.09 
 
 
348 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0312024  normal  0.982549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3905  hypothetical protein  41.98 
 
 
308 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0813  hypothetical protein  32.28 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0872  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0904  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0841  hypothetical protein  31.93 
 
 
302 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.820957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1728  hypothetical protein  33.78 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000954712  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1534  hypothetical protein  34.98 
 
 
309 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451819  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0927  hypothetical protein  31.58 
 
 
302 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0688121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5209  uncharacterized membrane-anchored protein  35.32 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0652366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0325  uncharacterized membrane-anchored protein  35.8 
 
 
320 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116577  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4682  uncharacterized membrane-anchored protein  35.32 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4944  uncharacterized membrane-anchored protein  35.4 
 
 
339 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.0671583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5324  uncharacterized membrane-anchored protein  34.96 
 
 
339 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3042  uncharacterized membrane-anchored protein  34.96 
 
 
339 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2523  putative transmembrane protein  29.72 
 
 
303 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.034862  hitchhiker  0.0063146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1083  Uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  31.23 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2467  hypothetical protein  28.74 
 
 
285 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2802  putative transmembrane protein  27.45 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>