23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3535 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3535  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  673    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4272  uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  65.22 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3256  putative uncharacterized membrane-anchored protein  43.79 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07961  hypothetical protein  45.9 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1786  hypothetical protein  48.25 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0312024  normal  0.982549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3905  hypothetical protein  45.62 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1534  hypothetical protein  45.42 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1728  hypothetical protein  45.45 
 
 		 307 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000954712  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2523  putative transmembrane protein  38.5 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.034862  hitchhiker  0.0063146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0872  hypothetical protein  34.5 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0841  hypothetical protein  34.5 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.820957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0904  hypothetical protein  34.5 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0813  hypothetical protein  34.5 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0927  hypothetical protein  33.72 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0688121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0325  uncharacterized membrane-anchored protein  33.47 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4944  uncharacterized membrane-anchored protein  34.11 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.0671583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5324  uncharacterized membrane-anchored protein  34.11 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3042  uncharacterized membrane-anchored protein  34.11 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5209  uncharacterized membrane-anchored protein  32.63 
 
 		 317 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0652366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4682  uncharacterized membrane-anchored protein  32.2 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2467  hypothetical protein  30.53 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1083  Uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  30.38 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2802  putative transmembrane protein  37.23 
 
 		 275 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>