23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2523 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2523  putative transmembrane protein  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.034862  hitchhiker  0.0063146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2802  putative transmembrane protein  76.92 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0325  uncharacterized membrane-anchored protein  44.95 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5209  uncharacterized membrane-anchored protein  46.18 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0652366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4682  uncharacterized membrane-anchored protein  45.83 
 
 		 317 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4944  uncharacterized membrane-anchored protein  45.14 
 
 		 339 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.0671583 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5324  uncharacterized membrane-anchored protein  45.14 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3042  uncharacterized membrane-anchored protein  45.14 
 
 		 339 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0841  hypothetical protein  44.79 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.820957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0872  hypothetical protein  44.79 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0813  hypothetical protein  44.79 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0904  hypothetical protein  44.44 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0927  hypothetical protein  43.75 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0688121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3905  hypothetical protein  38.96 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07961  hypothetical protein  27.78 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3535  hypothetical protein  34.51 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4272  uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  31.97 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3256  putative uncharacterized membrane-anchored protein  31.3 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2467  hypothetical protein  35.68 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1786  hypothetical protein  34.41 
 
 		 348 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0312024  normal  0.982549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1534  hypothetical protein  37.14 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1083  Uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  29.67 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1728  hypothetical protein  35.06 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000954712  normal  0.0885177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>