23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5324 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4944  uncharacterized membrane-anchored protein  99.12 
 
 
339 aa  674    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.0671583 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3042  uncharacterized membrane-anchored protein  100 
 
 
339 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5324  uncharacterized membrane-anchored protein  100 
 
 
339 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0325  uncharacterized membrane-anchored protein  92.5 
 
 
320 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116577  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5209  uncharacterized membrane-anchored protein  89.38 
 
 
317 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0652366 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4682  uncharacterized membrane-anchored protein  88.96 
 
 
317 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2523  putative transmembrane protein  45.14 
 
 
303 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.034862  hitchhiker  0.0063146 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0872  hypothetical protein  41.78 
 
 
302 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0904  hypothetical protein  41.78 
 
 
302 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0841  hypothetical protein  41.78 
 
 
302 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.820957  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0813  hypothetical protein  41.78 
 
 
302 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0927  hypothetical protein  41.44 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0688121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2802  putative transmembrane protein  45.41 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07961  hypothetical protein  34.8 
 
 
314 aa  146  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3905  hypothetical protein  39.35 
 
 
308 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4272  uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  33.77 
 
 
297 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3256  putative uncharacterized membrane-anchored protein  31.35 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1786  hypothetical protein  35.89 
 
 
348 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0312024  normal  0.982549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2467  hypothetical protein  27.92 
 
 
285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206693  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3535  hypothetical protein  33.6 
 
 
330 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1083  Uncharacterized membrane-anchored protein-like protein  31.5 
 
 
335 aa  99.4  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1534  hypothetical protein  33.33 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.451819  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1728  hypothetical protein  30.72 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000954712  normal  0.0885177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>