21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4041 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4041  yiaA/B two helix domain-containing protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  0.0976535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3873  putative inner membrane protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3982  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3936  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.624616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3854  YiaA/B two helix domain family  99.15 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3886  hypothetical protein  34.74 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4939  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.13194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4059  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03415  conserved inner membrane protein  33.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03366  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0151  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3766  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0147  YiaAB two helix domain protein  33.68 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  26.5 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>