26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3886 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3886  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03415  conserved inner membrane protein  95.58 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03366  hypothetical protein  95.58 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0151  hypothetical protein  95.58 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3766  hypothetical protein  95.58 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0147  YiaAB two helix domain protein  95.58 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4939  hypothetical protein  95.54 
 
 		 113 aa  216  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.13194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4059  hypothetical protein  95.54 
 
 		 113 aa  216  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3962  yiaA/B two helix domain family protein  92.86 
 
 		 75 aa  134  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3854  YiaA/B two helix domain family  35.79 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4041  yiaA/B two helix domain-containing protein  34.74 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.550863  normal  0.0976535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3873  putative inner membrane protein  34.74 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3982  hypothetical protein  34.74 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3936  hypothetical protein  34.74 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.624616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03414  conserved inner membrane protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03365  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4938  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.102561 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3885  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0152  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0148  YiaAB two helix domain protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4058  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3765  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.834078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0098  YiaAB two helix domain-containing protein  33.96 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365723  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2577  YiaAB two helix domain-containing protein  28 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04112  membrane protein  27.88 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0141  hypothetical protein  27.62 
 
 		 166 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>