26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B1569 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1569  inner membrane protein YdcZ  100 
 
 		 149 aa  282  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1706  inner membrane protein YdcZ  99.33 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1771  hypothetical protein  99.33 
 
 		 149 aa  281  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1709  inner membrane protein YdcZ  99.33 
 
 		 149 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0357484  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1750  inner membrane protein YdcZ  98.66 
 
 		 149 aa  278  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2053  hypothetical protein  87.25 
 
 		 149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000505775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2199  protein of unknown function DUF606  86.58 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1726  hypothetical protein  86.58 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2212  hypothetical protein  86.58 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1628  hypothetical protein  86.58 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1533  hypothetical protein  86.58 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01404  predicted inner membrane protein  85.91 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01415  hypothetical protein  85.91 
 
 		 149 aa  248  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1717  hypothetical protein  85.91 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2105  hypothetical protein  77.85 
 
 		 149 aa  232  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  27.59 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  25.98 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  27.61 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.46 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  25.55 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  26.28 
 
 		 148 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>