33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2053 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  283  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000505775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1726  hypothetical protein  99.33 
 
 		 149 aa  283  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2199  protein of unknown function DUF606  98.66 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2212  hypothetical protein  98.66 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1628  hypothetical protein  98.66 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1533  hypothetical protein  98.66 
 
 		 149 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01404  predicted inner membrane protein  97.99 
 
 		 149 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01415  hypothetical protein  97.99 
 
 		 149 aa  280  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1717  hypothetical protein  97.99 
 
 		 149 aa  280  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1709  inner membrane protein YdcZ  87.92 
 
 		 149 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0357484  normal  0.809506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1569  inner membrane protein YdcZ  87.25 
 
 		 149 aa  251  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1750  inner membrane protein YdcZ  87.25 
 
 		 149 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1771  hypothetical protein  87.25 
 
 		 149 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1706  inner membrane protein YdcZ  86.58 
 
 		 149 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2105  hypothetical protein  84.56 
 
 		 149 aa  248  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  31.47 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  29.61 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  26.98 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  28.28 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  25.36 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  34.12 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.01 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.21 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  28.16 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  26.95 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  29.2 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  32.14 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  29.66 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  32.98 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>