115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3671 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
580 aa  1192    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3675  hypothetical protein  97.89 
 
 
143 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  32.95 
 
 
787 aa  180  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3415  microbial collagenase  36.83 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5678  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.72 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0596714  decreased coverage  0.000827324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1830  microbial collagenase  36.53 
 
 
458 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000167843  normal  0.0782319 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.69 
 
 
529 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.54 
 
 
647 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1214  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
785 aa  151  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3605  serine protease  32.59 
 
 
613 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3502  serine protease  32.59 
 
 
613 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000122382  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3892  serine protease  32.59 
 
 
613 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000928217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3514  serine protease  32.59 
 
 
613 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3772  serine protease, subtilase family  32.35 
 
 
613 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000373923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3794  serine protease  33.09 
 
 
613 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000410497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3861  serine protease, subtilase family  33.58 
 
 
613 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1437  serine protease, subtilase family  33.09 
 
 
613 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000606827  hitchhiker  0.00102573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1091  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.45 
 
 
739 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.21 
 
 
462 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.42 
 
 
634 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 
483 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
771 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.07 
 
 
498 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
482 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.93 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0545  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 
617 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0878069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.3 
 
 
615 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.19 
 
 
1054 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.81 
 
 
397 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
589 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  23.49 
 
 
297 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
589 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  27.53 
 
 
1315 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
601 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.86 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0653  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 
360 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.04 
 
 
615 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  34.48 
 
 
995 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  26.59 
 
 
641 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  23.4 
 
 
307 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  27.15 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  27.13 
 
 
397 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  27.48 
 
 
397 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.58 
 
 
638 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 
587 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
1029 aa  53.5  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 
479 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  33.62 
 
 
991 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 
797 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  26.26 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  26.5 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.35 
 
 
579 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  26.5 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.04 
 
 
882 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  26.49 
 
 
397 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.97 
 
 
577 aa  50.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  25.86 
 
 
576 aa  50.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 
1383 aa  50.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5496  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.99 
 
 
635 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.252703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  25.18 
 
 
692 aa  50.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.36 
 
 
423 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  23.34 
 
 
298 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  27.99 
 
 
606 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.17 
 
 
1454 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  25.18 
 
 
891 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  24.7 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.22 
 
 
739 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.4 
 
 
298 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  26.71 
 
 
315 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 
868 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
627 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.86 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.45 
 
 
520 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
646 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4102  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
646 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.246313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  29.63 
 
 
606 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
836 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.6 
 
 
440 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.32 
 
 
639 aa  47.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
487 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.25 
 
 
699 aa  47.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.76 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.08 
 
 
506 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4961  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.9 
 
 
437 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504189  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25.48 
 
 
1333 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  25.76 
 
 
315 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1770  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
527 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.4 
 
 
983 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  25.35 
 
 
339 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.84 
 
 
1272 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 
692 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.51 
 
 
653 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 
465 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 
399 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3267  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.86 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.112801 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.1 
 
 
517 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  27.31 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>