9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3986 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3986  DNA polymerase III, beta chain  100 
 
 		 154 aa  316  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.563929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3435  hypothetical protein  54.25 
 
 		 154 aa  186  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1513  hypothetical protein  34.64 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1824  hypothetical protein  31.33 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2127  hypothetical protein  30.65 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0024  hypothetical protein  28.33 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309029  normal  0.358699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2019  hypothetical protein  26.71 
 
 		 285 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0278407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0080  hypothetical protein  30.25 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1916  hypothetical protein  26.52 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>