10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2127 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2127  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3986  DNA polymerase III, beta chain  30.65 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.563929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0024  hypothetical protein  35.85 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309029  normal  0.358699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1513  hypothetical protein  31.76 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3435  hypothetical protein  24.84 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1824  hypothetical protein  29.91 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0994  hypothetical protein  26.79 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3295  hypothetical protein  27.88 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3416  hypothetical protein  22.69 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0080  hypothetical protein  27.19 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>