10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1824 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1824  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  353  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1513  hypothetical protein  27.5 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3986  DNA polymerase III, beta chain  31.33 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.563929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0024  hypothetical protein  33 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309029  normal  0.358699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3435  hypothetical protein  28.18 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186585 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2127  hypothetical protein  29.91 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4907  hypothetical protein  26.32 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56380  hypothetical protein  25.56 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0080  hypothetical protein  28.7 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3416  hypothetical protein  26.09 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>