14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0080 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0080  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  330  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0994  hypothetical protein  61.97 
 
 		 146 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3416  hypothetical protein  63.12 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3295  hypothetical protein  62.04 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1482  hypothetical protein  48.92 
 
 		 140 aa  147  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0387  hypothetical protein  50.35 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.98134e-17  normal  0.0138646 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003308  hypothetical protein  51.01 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3048  hypothetical protein  62.03 
 
 		 79 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4331  hypothetical protein  37.93 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04809  lipoprotein  29.41 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0539958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1000  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.207524  normal  0.0679832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3986  DNA polymerase III, beta chain  30.25 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.563929 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1824  hypothetical protein  28.7 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2127  hypothetical protein  27.19 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.869401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>