55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0121 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  100 
 
 
402 aa  184  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  98.86 
 
 
399 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  97.73 
 
 
399 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  97.73 
 
 
394 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0121  transposase  100 
 
 
88 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0001  IS1294, transposase, truncation  93.1 
 
 
193 aa  171  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.040816  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  61.36 
 
 
409 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  61.36 
 
 
409 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0113  transposase  92.98 
 
 
57 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683596  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  37.21 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0131  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3056  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3035  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2969  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.130301  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0256  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1445  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0040  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0022  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0359  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.36865  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0117  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0130  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0188  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0202  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0529796  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_26  putative transposase  41.67 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181682  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0208  transposase  41.67 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_18  putative transposase  41.67 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.424546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1097  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.930586  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1086  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0442  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0829  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.302329  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0875  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0900  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0970  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0151073  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0990  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_03  transposase, IS91 family  41.67 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1048  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0106  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0014  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0019  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0035  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0050  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.677312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0056  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1001  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1166  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0692349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1335  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1430  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1683  transposase  41.67 
 
 
359 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1708  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.53086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1720  transposase  41.67 
 
 
358 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2853  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652779  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3039  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0017  transposase  41.67 
 
 
396 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0084  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0107  transposase  41.67 
 
 
397 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0008  ISPsy3, transposase, internal deletion  46.55 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>