11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0113 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0113  transposase  100 
 
 		 57 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.683596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4229  IS1294, transposase  94.74 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0286  IS1294, transposase  92.98 
 
 		 399 aa  114  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.08654e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0295  IS1294, transposase  92.98 
 
 		 394 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000829829  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0105  IS1294, transposase  92.98 
 
 		 402 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0001  IS1294, transposase, truncation  92.86 
 
 		 193 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.040816  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0121  transposase  92.98 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0009  ISPsy3, transposase  63.64 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0002  ISPsy3, transposase  63.64 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0008  ISPsy3, transposase, internal deletion  47.37 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_45  transposase  37.5 
 
 		 393 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0298487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>