38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0903 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  178  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  76.4 
 
 
110 aa  140  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  73.33 
 
 
115 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  63.64 
 
 
119 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  62.07 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  59.77 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  58.62 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  60.23 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  60.23 
 
 
152 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  59.77 
 
 
111 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  62.2 
 
 
125 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  60 
 
 
124 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  55.81 
 
 
123 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  54.65 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  53.49 
 
 
122 aa  93.2  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  54.55 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  53.49 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  56.96 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  53.49 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  52.33 
 
 
122 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  53.49 
 
 
123 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  56.58 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  50.57 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  48.86 
 
 
133 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  51.76 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  48.31 
 
 
130 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  48.86 
 
 
133 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  54.43 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  54.43 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  49.43 
 
 
137 aa  87.4  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  51.22 
 
 
135 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  50.57 
 
 
139 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  49.4 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  52.44 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  41.38 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  34.09 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>