38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3736 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  274  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  95.49 
 
 
136 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  73.38 
 
 
139 aa  210  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  73.48 
 
 
136 aa  207  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  70.71 
 
 
130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  60.66 
 
 
128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  66.35 
 
 
133 aa  147  6e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  66.35 
 
 
133 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  60.36 
 
 
137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  53.91 
 
 
123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  62.26 
 
 
123 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  62.86 
 
 
122 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  61.39 
 
 
123 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  66.32 
 
 
122 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  64.29 
 
 
117 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  56.25 
 
 
122 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  65.26 
 
 
135 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  58.59 
 
 
124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  56.36 
 
 
116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  62.24 
 
 
121 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  56.44 
 
 
112 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  57.29 
 
 
125 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  56 
 
 
129 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  60.82 
 
 
113 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  45.77 
 
 
152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  56.7 
 
 
113 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  58.06 
 
 
111 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  56.84 
 
 
128 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  56.12 
 
 
124 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  54.74 
 
 
131 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  54.74 
 
 
131 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  58.7 
 
 
111 aa  114  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  56.7 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  54.08 
 
 
119 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  53 
 
 
110 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  50.51 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  36.04 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>