38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0104 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  231  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  74.77 
 
 
112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  71.03 
 
 
111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  71.82 
 
 
119 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  72.07 
 
 
152 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  72.07 
 
 
113 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  74.76 
 
 
116 aa  159  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  59.6 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  59.6 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  61.54 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  61.96 
 
 
139 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  54.08 
 
 
137 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  60.82 
 
 
136 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  61 
 
 
122 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  59.78 
 
 
130 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  60.82 
 
 
133 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  63.92 
 
 
125 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  62.37 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  58.65 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  58 
 
 
122 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  57 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  54.87 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  58 
 
 
123 aa  117  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  59.78 
 
 
136 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  57.84 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  61.29 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  52.34 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  56.7 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  56.57 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  58.16 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  56.57 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  58.89 
 
 
124 aa  111  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  53.27 
 
 
128 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  62.07 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  56.52 
 
 
128 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  49.07 
 
 
129 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  49.48 
 
 
111 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  45.45 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>