38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3088 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  37.25 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  36.44 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  34.55 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  34.55 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  36.27 
 
 		 136 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  37.25 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  37.25 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  36.11 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  35.42 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  34.69 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  37.37 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  34.91 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  52.63 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  36.08 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  34.65 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  36.08 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  33.66 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  43.55 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  40.96 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  48.15 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  30.61 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  47.27 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  42.65 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  31.96 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  34.74 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>