38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4523 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  92.8 
 
 
124 aa  230  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  69.49 
 
 
124 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  61.72 
 
 
128 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  59.85 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  59.85 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  62.5 
 
 
129 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  66.06 
 
 
123 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  58.33 
 
 
130 aa  139  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  56.56 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  66.67 
 
 
135 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  57.27 
 
 
133 aa  137  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  57.27 
 
 
133 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  53.33 
 
 
123 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  58.04 
 
 
122 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  60.58 
 
 
123 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  61.76 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  63.81 
 
 
116 aa  131  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  63.16 
 
 
122 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  54.29 
 
 
136 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  48.78 
 
 
136 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  67.31 
 
 
113 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  67.31 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  55.24 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  56.73 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  64.84 
 
 
121 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  63.21 
 
 
112 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  51.56 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  60.19 
 
 
111 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  65.69 
 
 
119 aa  123  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  63.92 
 
 
113 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  56.12 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  55.34 
 
 
115 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  57.69 
 
 
110 aa  110  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  53.76 
 
 
111 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  61.18 
 
 
90 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  32.73 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>