38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0202 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  233  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.770979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0527  hypothetical protein  80.67 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0325  hypothetical protein  79.17 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0197  hypothetical protein  80.17 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0289  hypothetical protein  79.83 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420526  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0406  hypothetical protein  78.33 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0384  hypothetical protein  79.31 
 
 		 121 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0102  hypothetical protein  69.39 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.361853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0090  hypothetical protein  68.37 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.93975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0088  hypothetical protein  68.37 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0827  hypothetical protein  64.15 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.352326 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3850  hypothetical protein  61.06 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3672  hypothetical protein  57.26 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3355  hypothetical protein  70.53 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1021  hypothetical protein  65 
 
 		 124 aa  137  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197468  normal  0.217201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4059  hypothetical protein  65.31 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3081  hypothetical protein  64.29 
 
 		 136 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4523  hypothetical protein  64.21 
 
 		 125 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3736  hypothetical protein  64.29 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4185  hypothetical protein  61.22 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.686225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1960  hypothetical protein  62.11 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1911  hypothetical protein  54.1 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.27328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2281  hypothetical protein  62.11 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2004  hypothetical protein  62.11 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1396  hypothetical protein  64.84 
 
 		 137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3232  hypothetical protein  61.05 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2794  hypothetical protein  58.95 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0104  hypothetical protein  58.65 
 
 		 113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3453  hypothetical protein  56.44 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2562  hypothetical protein  61.96 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.085644  normal  0.498503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1133  hypothetical protein  58.95 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0044  hypothetical protein  53.51 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0529  hypothetical protein  58.95 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4992  hypothetical protein  56.52 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.988193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3584  hypothetical protein  56.7 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2910  hypothetical protein  51.06 
 
 		 111 aa  106  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0903  hypothetical protein  53.49 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3088  hypothetical protein  34.65 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>