14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1567 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1567  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.952143  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1115  hypothetical protein  56.54 
 
 		 236 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23880  hypothetical protein  34.88 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0124929  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1290  hypothetical protein  42.08 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0067  hypothetical protein  27.75 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.621023  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1931  hypothetical protein  30.34 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  42.25 
 
 		 1888 aa  59.7  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  37.5 
 
 		 1281 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  45.31 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.03 
 
 		 840 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.48 
 
 		 268 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  28 
 
 		 2313 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03300  microtubule binding protein, putative  41.89 
 
 		 694 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  31.25 
 
 		 687 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>