17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1679 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1679  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  201  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2560  protein of unknown function DUF554  41.25 
 
 
236 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000206819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1160  protein of unknown function DUF554  29.9 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3084  protein of unknown function DUF554  26.8 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2899  protein of unknown function DUF554  26.8 
 
 
239 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000109146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3365  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal  0.509414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3357  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.930348 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3291  YqgA  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3280  YqgA  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3460  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3381  hypothetical protein  27.55 
 
 
237 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1252  hypothetical protein  25.77 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000565892  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3019  hypothetical protein  29.49 
 
 
290 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0507  hypothetical protein  34.65 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2488  hypothetical protein  31.25 
 
 
228 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000155229  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1541  protein of unknown function DUF554  28.12 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.766682  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1140  hypothetical protein  28.24 
 
 
230 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>