37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2833 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2833  replication P family protein  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.287984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1015  phage replication protein P  51.55 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2261  putative phage replication protein  45.04 
 
 		 154 aa  119  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000554062  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1425  hypothetical protein  40.12 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1390  replication P family protein  40.85 
 
 		 140 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.40856e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1757  hypothetical protein  40.97 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  hitchhiker  0.00110469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3165  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  hitchhiker  0.000000000000154786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1834  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000190393  hitchhiker  0.0000000000000434727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1511  hypothetical protein  40.97 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.819645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2807  hypothetical protein  40.97 
 
 		 140 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00722  hypothetical protein  35 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10025  DNA replication protein  35 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0811  replication protein P  35 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1601  replication protein P  33.5 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3552  replication protein P  33.5 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0821643  hitchhiker  6.45251e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2208  hypothetical protein  39.58 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  hitchhiker  4.6983500000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1162  hypothetical protein  39.58 
 
 		 140 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000095784  hitchhiker  1.77161e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1120  replication protein P  34.5 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  0.739482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1401  replication protein P  28.71 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00608278  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1022  replication P family protein  41.86 
 
 		 239 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3230  replication protein P  38.05 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  hitchhiker  0.000457517 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1976  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00391127  normal  0.0441254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3393  replication P family protein  28.75 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2557  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3489  replication P family protein  28.75 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105154  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3365  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3256  replication P family protein  28.75 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.944722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1971  replication P family protein  28.75 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1859  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0744  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3611  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000384239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0771  replication P family protein  28.12 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0729931  normal  0.268391 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0774  replication P family protein  28.75 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2026  replication P family protein  28.12 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125525  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3393  hypothetical protein  39.76 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000119409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1654  replication P family protein  31 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00054623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3262  replication P  27.07 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0602969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>