12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1162 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1162  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  291  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000095784  hitchhiker  1.77161e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2208  hypothetical protein  99.29 
 
 		 153 aa  290  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  hitchhiker  4.6983500000000005e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1511  hypothetical protein  91.43 
 
 		 140 aa  269  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.819645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2807  hypothetical protein  90.71 
 
 		 140 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1834  hypothetical protein  90 
 
 		 140 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000190393  hitchhiker  0.0000000000000434727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3165  hypothetical protein  90 
 
 		 140 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  hitchhiker  0.000000000000154786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1757  hypothetical protein  89.29 
 
 		 140 aa  265  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  hitchhiker  0.00110469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1425  hypothetical protein  87.86 
 
 		 221 aa  258  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2261  putative phage replication protein  74.29 
 
 		 154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000554062  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1390  replication P family protein  74.64 
 
 		 140 aa  228  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.40856e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1015  phage replication protein P  45.74 
 
 		 228 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2833  replication P family protein  39.58 
 
 		 231 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.287984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>