37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1015 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1015  phage replication protein P  100 
 
 
228 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2833  replication P family protein  51.55 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.287984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3552  replication protein P  48.76 
 
 
233 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0821643  hitchhiker  6.45251e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1601  replication protein P  48.76 
 
 
233 aa  202  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102018 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00722  hypothetical protein  49.25 
 
 
233 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10025  DNA replication protein  49.25 
 
 
233 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0811  replication protein P  48.26 
 
 
233 aa  198  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1120  replication protein P  50 
 
 
233 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  0.739482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2261  putative phage replication protein  44.96 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000554062  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1390  replication P family protein  47.24 
 
 
140 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.40856e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1757  hypothetical protein  49.61 
 
 
140 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  hitchhiker  0.00110469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1834  hypothetical protein  48.84 
 
 
140 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000190393  hitchhiker  0.0000000000000434727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3165  hypothetical protein  48.84 
 
 
140 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  hitchhiker  0.000000000000154786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1511  hypothetical protein  47.29 
 
 
140 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.819645  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1425  hypothetical protein  47.29 
 
 
221 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2807  hypothetical protein  48.06 
 
 
140 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2208  hypothetical protein  46.51 
 
 
153 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  hitchhiker  4.6983500000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1162  hypothetical protein  45.74 
 
 
140 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000095784  hitchhiker  1.77161e-18 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1401  replication protein P  32.43 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00608278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3230  replication protein P  35.4 
 
 
145 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  hitchhiker  0.000457517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1022  replication P family protein  34.62 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1976  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00391127  normal  0.0441254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3489  replication P family protein  34.94 
 
 
227 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105154  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3393  replication P family protein  34.94 
 
 
227 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2026  replication P family protein  34.94 
 
 
227 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125525  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2557  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1859  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3256  replication P family protein  34.94 
 
 
227 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.944722  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1971  replication P family protein  34.94 
 
 
227 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0774  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3365  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0744  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543222  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3611  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000384239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0771  replication P family protein  34.94 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0729931  normal  0.268391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3393  hypothetical protein  30.49 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000119409  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3262  replication P  29.35 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0602969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1654  replication P family protein  29.76 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00054623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>