12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1390 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1390  replication P family protein  100 
 
 		 140 aa  290  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.40856e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2261  putative phage replication protein  79.29 
 
 		 154 aa  246  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000554062  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2807  hypothetical protein  77.54 
 
 		 140 aa  236  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.839065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1834  hypothetical protein  77.54 
 
 		 140 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000190393  hitchhiker  0.0000000000000434727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3165  hypothetical protein  77.54 
 
 		 140 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  hitchhiker  0.000000000000154786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1511  hypothetical protein  76.81 
 
 		 140 aa  233  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.819645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1757  hypothetical protein  76.09 
 
 		 140 aa  233  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  hitchhiker  0.00110469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2208  hypothetical protein  75.36 
 
 		 153 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  hitchhiker  4.6983500000000005e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1425  hypothetical protein  76.09 
 
 		 221 aa  229  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000229139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1162  hypothetical protein  74.64 
 
 		 140 aa  228  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000095784  hitchhiker  1.77161e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1015  phage replication protein P  47.24 
 
 		 228 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2833  replication P family protein  40.85 
 
 		 231 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.287984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>