29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1654 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1654  replication P family protein  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00054623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3262  replication P  78.18 
 
 		 221 aa  361  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0602969  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3489  replication P family protein  63.18 
 
 		 227 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0105154  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3393  replication P family protein  63.64 
 
 		 227 aa  298  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3256  replication P family protein  63.18 
 
 		 227 aa  296  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.944722  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2026  replication P family protein  63.18 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125525  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1971  replication P family protein  63.18 
 
 		 227 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188729  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1859  replication P family protein  62.44 
 
 		 228 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2557  replication P family protein  62.9 
 
 		 228 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1976  replication P family protein  62.9 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00391127  normal  0.0441254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3365  replication P family protein  62.9 
 
 		 228 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0744  replication P family protein  62.44 
 
 		 228 aa  290  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.543222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0774  replication P family protein  62.44 
 
 		 228 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3611  replication P family protein  62.44 
 
 		 228 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000384239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0771  replication P family protein  61.99 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0729931  normal  0.268391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1022  replication P family protein  36.17 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2984  hypothetical protein  32.08 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.381401  hitchhiker  0.0010663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3393  hypothetical protein  28.26 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000119409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0811  replication protein P  24.49 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1601  replication protein P  24.37 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102018 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3552  replication protein P  23.86 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0821643  hitchhiker  6.45251e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10025  DNA replication protein  23.86 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00722  hypothetical protein  23.86 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106107  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2833  replication P family protein  31 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.287984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1120  replication protein P  21.96 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  0.739482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0401  hypothetical protein  24.68 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.68677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1015  phage replication protein P  29.76 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103385  unclonable  0.00000339915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1401  replication protein P  26.13 
 
 		 230 aa  45.1  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00608278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>