50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2752 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  99.04 
 
 		 209 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  73.58 
 
 		 212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  57.49 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  55.29 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  55.29 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  55.29 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  58.64 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  55.34 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  56.31 
 
 		 219 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  53.88 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  32.37 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  32.38 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  32.88 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  29.29 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  27.64 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  26.7 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  25.89 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  28.14 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  26.44 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  27.92 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  25.23 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  25.23 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  29.63 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  25.48 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  27.27 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  24.66 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  25.58 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  24.62 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  25.33 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  27.27 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  25.13 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  23.98 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  24.49 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  22.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  24.49 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  26.84 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  24.87 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  23.36 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  25.45 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  26.17 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.47 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.66 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  22.93 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  25.79 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>