56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2906 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  447  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  51.4 
 
 		 217 aa  227  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  52.83 
 
 		 217 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  53.06 
 
 		 217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  52.53 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  50 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  47.12 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  44.44 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  41.06 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  41.36 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  37.13 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  36.57 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  36.57 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  37.04 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  38.58 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  36.55 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  36.08 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  31.32 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  31.1 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  31.1 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  36.6 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  31.4 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  32.14 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  29.47 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  30.84 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  27.45 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  27.23 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  27.48 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  29.36 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  31.28 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  26.11 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  29.14 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  25.23 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  28.44 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  28.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  28.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  28.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  23.89 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  29.25 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  26.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  30.07 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  25.66 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  26.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  26.44 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  26.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  28 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  26.44 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  24.74 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  28.48 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.79 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1080  hypothetical protein  23.87 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  20.56 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  24.09 
 
 		 433 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  23.61 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>