55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0392 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  46.82 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  46.51 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  47.12 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  49.74 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  44.65 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  40.72 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  40.72 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  43.68 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  41.03 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  43.65 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  41.12 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0278  protein of unknown function DUF1007  43.39 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1783  protein of unknown function DUF1007  36.32 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  36.68 
 
 		 221 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2203  hypothetical protein  37.09 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0980814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2712  hypothetical protein  28.64 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2375  protein of unknown function DUF1007  28.44 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1043  protein of unknown function DUF1007  38.85 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  27.62 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0097  hypothetical protein  30.29 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0089  hypothetical protein  30.29 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.516634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  27.94 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  29.27 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  26.64 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  35.95 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  26.94 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0675  protein of unknown function DUF1007  26.29 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.019732 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  29.73 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  27.1 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3209  hypothetical protein  26.53 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0752  protein of unknown function DUF1007  27.23 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000375765  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1271  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00860281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0440  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000354485  hitchhiker  0.00000494731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1163  hypothetical protein  28.05 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000035271  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  29.61 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3042  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0486722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  26.57 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  29.41 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2707  hypothetical protein  25.48 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2927  hypothetical protein  25.48 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2814  hypothetical protein  25.48 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2752  hypothetical protein  25.48 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1738  hypothetical protein  23.53 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0927626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2793  hypothetical protein  25.48 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  28.37 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.82 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1594  polyphosphate kinase  26.43 
 
 		 433 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0936012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3691  protein of unknown function DUF1007  21.88 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.6 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0833  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component related protein  22.8 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1928  hypothetical protein  24.89 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.449799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  28.74 
 
 		 215 aa  42  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>