More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0926 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0987  electron transfer flavoprotein subunit alpha  100 
 
 
315 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0926  electron transfer flavoprotein subunit alpha  100 
 
 
315 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1007  electron transfer flavoprotein subunit alpha  99.37 
 
 
317 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0958  electron transfer flavoprotein subunit alpha  99.05 
 
 
317 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.81 
 
 
310 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.05 
 
 
313 aa  352  7e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  57.78 
 
 
315 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.05 
 
 
311 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.05 
 
 
311 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.05 
 
 
311 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.37 
 
 
310 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  58.73 
 
 
311 aa  345  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.05 
 
 
311 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.41 
 
 
310 aa  342  4e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.16 
 
 
310 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  57.68 
 
 
314 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.1 
 
 
311 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2169  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.32 
 
 
310 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0328573  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.41 
 
 
311 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  56.51 
 
 
309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.37 
 
 
310 aa  338  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.73 
 
 
313 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.14 
 
 
311 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.78 
 
 
310 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  53.33 
 
 
312 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.66 
 
 
309 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.19 
 
 
309 aa  331  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  53.02 
 
 
312 aa  331  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.09 
 
 
314 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.24 
 
 
309 aa  330  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4306  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.37 
 
 
310 aa  331  1e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.46 
 
 
310 aa  329  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.37 
 
 
310 aa  328  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  56.51 
 
 
311 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.05 
 
 
310 aa  328  9e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.19 
 
 
309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2092  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.33 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.46 
 
 
308 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.46 
 
 
308 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.73 
 
 
310 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.1 
 
 
310 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.1 
 
 
310 aa  325  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  54.29 
 
 
310 aa  325  8.000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.65 
 
 
314 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.65 
 
 
311 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.19 
 
 
308 aa  323  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.46 
 
 
310 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  53.02 
 
 
314 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.59 
 
 
309 aa  322  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.31 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  55.31 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  56.05 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.63 
 
 
309 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.19 
 
 
308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.63 
 
 
309 aa  318  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  53.35 
 
 
327 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.05 
 
 
310 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.6 
 
 
307 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.91 
 
 
309 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  57.56 
 
 
309 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.56 
 
 
312 aa  316  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.98 
 
 
309 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.97 
 
 
309 aa  315  5e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.02 
 
 
307 aa  315  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.92 
 
 
310 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.63 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.92 
 
 
308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.8 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.97 
 
 
308 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.83 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.87 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.33 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.27 
 
 
321 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.34 
 
 
309 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.65 
 
 
308 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.65 
 
 
308 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.02 
 
 
313 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.34 
 
 
309 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.65 
 
 
308 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  53.65 
 
 
310 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.85 
 
 
319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.29 
 
 
313 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.73 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.63 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  51.71 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.75 
 
 
310 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.27 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.02 
 
 
310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  58.2 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.6 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>