212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0612 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0612  sodium transport family protein  100 
 
 
452 aa  897    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1082  H(+)-transporting two-sector ATPase  82.52 
 
 
452 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.268804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1104  H(+)-transporting two-sector ATPase  82.52 
 
 
452 aa  761    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000257723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1045  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.89 
 
 
449 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  49.89 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.67 
 
 
449 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1473  sodium transporter family protein  50.33 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1210  cation transporter  49.89 
 
 
449 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1212  cation transporter  49.89 
 
 
449 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1408  sodium transporter family protein  49.89 
 
 
449 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1371  sodium transporter family protein  50.33 
 
 
449 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1432  sodium transporter family protein  49.89 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1233  sodium transporter family protein  49.89 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1333  sodium transporter family protein  49.89 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0518  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.45 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.32097  normal  0.402385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  38.63 
 
 
446 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000213719  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  35.41 
 
 
441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  35.51 
 
 
446 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000154787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  36.04 
 
 
443 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  34.61 
 
 
445 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  35.65 
 
 
451 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.5 
 
 
453 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.71 
 
 
455 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000197091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  34.73 
 
 
444 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000038325  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.97 
 
 
442 aa  227  3e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  35.11 
 
 
450 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  33.26 
 
 
447 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  33.03 
 
 
447 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  33.03 
 
 
447 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  33.26 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  32.81 
 
 
447 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  32.81 
 
 
447 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  32.81 
 
 
447 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  34.37 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  33.11 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  32.81 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  33.04 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  34.3 
 
 
447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000106231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  32.58 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  32.58 
 
 
447 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.76 
 
 
456 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.36 
 
 
435 aa  216  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.36 
 
 
435 aa  216  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  33.55 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  33.63 
 
 
458 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1780  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.68 
 
 
453 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.223329  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf452  potassium uptake protein B  30.21 
 
 
523 aa  211  2e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.437031  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1927  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.52 
 
 
430 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  31.24 
 
 
443 aa  209  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000278363  decreased coverage  8.777620000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  34.98 
 
 
446 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  34.89 
 
 
446 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.1 
 
 
473 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0429  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.38 
 
 
461 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  33.33 
 
 
457 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2088  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.71 
 
 
453 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  33.18 
 
 
469 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2640  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.62 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1794  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.4 
 
 
453 aa  200  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  36.69 
 
 
471 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000433945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06990  Trk-type K+ transport system, membrane component  31.54 
 
 
458 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.393  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  31.57 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0727  potassium uptake protein, TrkH family  32.52 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.157517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  29.69 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  33.48 
 
 
453 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4805  K+ transporter Trk  32.94 
 
 
422 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1834  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.47 
 
 
633 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  32.65 
 
 
443 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1540  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.09 
 
 
454 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  30.77 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000161963  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2746  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.29 
 
 
457 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111298  hitchhiker  0.000348018 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  33.11 
 
 
447 aa  190  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  34.44 
 
 
456 aa  190  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4041  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.89 
 
 
709 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.707053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  32.82 
 
 
454 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0707  TrkH family potassium uptake protein , putative  31.87 
 
 
533 aa  189  8e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  32.82 
 
 
454 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2635  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.72 
 
 
616 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2521  cation transporter  30.09 
 
 
445 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0493111  normal  0.0380202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7572  cation transporter  33.33 
 
 
444 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.807634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4248  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.78 
 
 
443 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  33.71 
 
 
444 aa  187  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  30.22 
 
 
457 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1835  cation transporter  30.42 
 
 
586 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.120084  normal  0.898069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1607  K+ uptake transporter, KtrB subunit  30.42 
 
 
586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112335  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  31.21 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.13 
 
 
479 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.96 
 
 
448 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0506  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.87 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.042504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3208  potassium uptake protein, TrkH family  32.86 
 
 
443 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0458  sodium transport family protein  34.35 
 
 
435 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00291021  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  27.77 
 
 
454 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1462  potassium uptake protein, TrkH family  31.39 
 
 
443 aa  181  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000505239  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  31.77 
 
 
441 aa  181  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  28.88 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  28.79 
 
 
449 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000217077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1641  cation transport protein, putative  31.59 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0748  K+ transport protein  29.89 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.894633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  31.11 
 
 
432 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  31.42 
 
 
439 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0629  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.8 
 
 
457 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>