16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1135 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  94.59 
 
 		 111 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  67.57 
 
 		 111 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1063  hypothetical protein  52.83 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0767089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  54.13 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  47.75 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  47.66 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  38.04 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  32.71 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3467  Phage head-tail adaptor, putative  33.96 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0252975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  32.69 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  35.85 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  33.33 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  28.3 
 
 		 105 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.824958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>