18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4970 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  100 
 
 
117 aa  224  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1701  phage head-tail adaptor  65.26 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.228407  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1427  phage head-tail adaptor  65.26 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.157647  normal  0.2809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1423  phage head-tail adaptor  62.5 
 
 
112 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  34.65 
 
 
105 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  32.97 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  32.97 
 
 
112 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  38.83 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  34.74 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  35.78 
 
 
106 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0865  phage head-tail adaptor, putative  26.92 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  40.24 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  35.85 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  34.29 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  36.28 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  34.31 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  34.91 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  33.73 
 
 
109 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.50206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>