15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6053 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  94.59 
 
 		 111 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  69.37 
 
 		 111 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  54.13 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1063  hypothetical protein  51.89 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0767089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  49.55 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  46.73 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  34.58 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  36.96 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3467  Phage head-tail adaptor, putative  34.78 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0252975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  34.48 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  35.85 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>