16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1637 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1637  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1135  phage head-tail adaptor, putative  54.13 
 
 
111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.573897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1080  phage head-tail adaptor, putative  51.85 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.130936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1063  hypothetical protein  47.27 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0767089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2172  hypothetical protein  48.18 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6053  putative phage tail-head adaptor  54.13 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2896  head-tail adaptor, putative  47.01 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0591  hypothetical protein  28.71 
 
 
112 aa  57  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0592  hypothetical protein  28.71 
 
 
112 aa  57  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0909  phage head-tail adaptor, putative  32.99 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.824958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3159  phage head-tail adaptor, putative  27.52 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182206  normal  0.0118931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4970  phage head-tail adaptor  34.31 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2107  phage head-tail adaptor  39.53 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913965  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1340  hypothetical protein  27.45 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0268917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1981  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3467  Phage head-tail adaptor, putative  33.75 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0252975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>