More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3947 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  47.88 
 
 
792 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  45.19 
 
 
796 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  52.87 
 
 
780 aa  760    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.1 
 
 
787 aa  731    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  44.55 
 
 
797 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  92.86 
 
 
825 aa  1502    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
825 aa  1667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.46 
 
 
784 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.47 
 
 
787 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.64 
 
 
785 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.1 
 
 
785 aa  797    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.46 
 
 
779 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  65.05 
 
 
812 aa  1048    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.18 
 
 
794 aa  776    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  51.59 
 
 
801 aa  746    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.61 
 
 
816 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  49.64 
 
 
797 aa  681    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  45.83 
 
 
783 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  65.21 
 
 
782 aa  1040    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  50.18 
 
 
777 aa  733    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  50.98 
 
 
787 aa  730    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  50.55 
 
 
781 aa  744    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  54.69 
 
 
781 aa  813    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.43 
 
 
793 aa  734    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  51.6 
 
 
787 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.04 
 
 
779 aa  762    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  51.1 
 
 
787 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.55 
 
 
800 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  68.85 
 
 
781 aa  1097    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.33 
 
 
770 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.24 
 
 
812 aa  734    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  51.77 
 
 
784 aa  754    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  48.53 
 
 
799 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  92.74 
 
 
825 aa  1498    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  45.52 
 
 
772 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  46.58 
 
 
764 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  44.79 
 
 
800 aa  616  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  42.26 
 
 
779 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  44.31 
 
 
804 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  41.94 
 
 
856 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  44.24 
 
 
767 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  62.11 
 
 
777 aa  474  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  59.79 
 
 
797 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  56.5 
 
 
839 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  60.64 
 
 
779 aa  446  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  58.36 
 
 
799 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.67 
 
 
797 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  57.56 
 
 
798 aa  444  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  57.82 
 
 
799 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.03 
 
 
799 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  56.76 
 
 
799 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  55.97 
 
 
792 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.23 
 
 
799 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.5 
 
 
799 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.95 
 
 
828 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  55.35 
 
 
784 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  58.33 
 
 
802 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.64 
 
 
808 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  57.64 
 
 
788 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.26 
 
 
801 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.91 
 
 
788 aa  416  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.11 
 
 
801 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.53 
 
 
788 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.99 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.38 
 
 
788 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.87 
 
 
787 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  59.13 
 
 
818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.65 
 
 
788 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.33 
 
 
787 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  55.59 
 
 
793 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.6 
 
 
787 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.33 
 
 
787 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.6 
 
 
787 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.6 
 
 
787 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.14 
 
 
787 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.33 
 
 
787 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.33 
 
 
787 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.5 
 
 
814 aa  402  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.66 
 
 
823 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  57.94 
 
 
830 aa  399  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.94 
 
 
767 aa  389  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.22 
 
 
754 aa  289  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  45.16 
 
 
1363 aa  279  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  44.24 
 
 
1350 aa  276  8e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  42.86 
 
 
1387 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  28.76 
 
 
753 aa  271  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  40.52 
 
 
769 aa  270  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  27.42 
 
 
772 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0838  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.48 
 
 
781 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.97 
 
 
782 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0887  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.14 
 
 
727 aa  201  6e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  27.17 
 
 
797 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.55 
 
 
757 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4924  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  26.42 
 
 
831 aa  183  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.818439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1634  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.33 
 
 
972 aa  181  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.024681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20100  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, large subunit CoxL/CutL-like protein  27.54 
 
 
751 aa  181  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0809165  hitchhiker  0.000713838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2877  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  25.96 
 
 
790 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.956193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0827  putative selenate reductase subunit YgfN  26.53 
 
 
956 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1523  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  25.96 
 
 
790 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3041  putative selenate reductase subunit YgfN  26.35 
 
 
956 aa  178  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>