More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2301 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.61 
 
 
788 aa  767    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.51 
 
 
788 aa  792    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  47.08 
 
 
772 aa  668    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.77 
 
 
781 aa  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.73 
 
 
787 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.93 
 
 
818 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  71.45 
 
 
799 aa  1180    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.76 
 
 
779 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  52.29 
 
 
792 aa  777    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  60.37 
 
 
796 aa  931    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  53.66 
 
 
780 aa  769    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  49.03 
 
 
825 aa  710    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  70.73 
 
 
792 aa  1152    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.24 
 
 
787 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  69.76 
 
 
839 aa  1161    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.37 
 
 
787 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  52.17 
 
 
793 aa  798    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.37 
 
 
787 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  71.06 
 
 
797 aa  1171    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.41 
 
 
764 aa  759    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  48.91 
 
 
825 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.12 
 
 
788 aa  788    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.91 
 
 
784 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  52.88 
 
 
784 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  54.01 
 
 
779 aa  824    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.42 
 
 
787 aa  781    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.4 
 
 
787 aa  744    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.87 
 
 
808 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.5 
 
 
779 aa  771    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  53.34 
 
 
781 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  50.52 
 
 
812 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.91 
 
 
785 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.73 
 
 
787 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  47.13 
 
 
812 aa  704    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.7 
 
 
777 aa  796    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.24 
 
 
787 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  100 
 
 
797 aa  1652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  54.03 
 
 
828 aa  784    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.98 
 
 
794 aa  880    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.89 
 
 
801 aa  752    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  54.49 
 
 
802 aa  799    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.52 
 
 
788 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  70.8 
 
 
799 aa  1178    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  72.98 
 
 
799 aa  1186    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  50.66 
 
 
830 aa  720    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.47 
 
 
784 aa  775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  57.09 
 
 
797 aa  855    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  72.49 
 
 
797 aa  1149    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  55.31 
 
 
856 aa  854    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  52 
 
 
783 aa  780    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  46.29 
 
 
800 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.93 
 
 
801 aa  818    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  49.94 
 
 
782 aa  736    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  52.98 
 
 
777 aa  782    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  53.73 
 
 
787 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.53 
 
 
767 aa  706    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.37 
 
 
787 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.03 
 
 
800 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  55.03 
 
 
784 aa  842    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.75 
 
 
793 aa  760    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  44.62 
 
 
804 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  54.77 
 
 
781 aa  823    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  53.73 
 
 
787 aa  772    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  72.86 
 
 
799 aa  1190    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  55.1 
 
 
801 aa  815    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  53.87 
 
 
787 aa  787    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  72.28 
 
 
798 aa  1191    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.16 
 
 
785 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  51.9 
 
 
788 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.24 
 
 
787 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  53.5 
 
 
770 aa  755    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  49.25 
 
 
816 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  71.06 
 
 
799 aa  1170    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.01 
 
 
779 aa  818    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  54.24 
 
 
787 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.07 
 
 
814 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  72.09 
 
 
799 aa  1184    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  55.34 
 
 
823 aa  793    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  55.01 
 
 
799 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  43.36 
 
 
767 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  40.11 
 
 
769 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  39.63 
 
 
1363 aa  531  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  38.82 
 
 
1350 aa  521  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.36 
 
 
1387 aa  485  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  59.79 
 
 
825 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  32.1 
 
 
754 aa  372  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  31.4 
 
 
730 aa  318  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  29.31 
 
 
715 aa  274  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.46 
 
 
714 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1960  xanthine dehydrogenase subunit XdhA  28.34 
 
 
763 aa  260  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.308037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.66 
 
 
782 aa  259  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2835  4-hydroxybenzoyl-CoA reductase, alpha subunit  29.78 
 
 
797 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2136  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.49 
 
 
768 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.8 
 
 
753 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.44 
 
 
757 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  26.89 
 
 
713 aa  249  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3594  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  27.55 
 
 
774 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  28.42 
 
 
772 aa  246  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1504  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.53 
 
 
758 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1817  hypothetical protein  29.42 
 
 
766 aa  245  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>