More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4498 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1338  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.72 
 
 		 814 aa  772    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.01144  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2247  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.33 
 
 		 788 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3906  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  53.5 
 
 		 816 aa  771    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22280  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.65 
 
 		 797 aa  800    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.775322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2301  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.91 
 
 		 797 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.794851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4279  xanthine dehydrogenase, XdhB subunit  54.16 
 
 		 799 aa  804    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2862  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  76.58 
 
 		 779 aa  1197    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303628  normal  0.42301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2096  xanthine dehydrogenase subunit B  58.14 
 
 		 792 aa  852    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4865  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.61 
 
 		 796 aa  836    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0350  xanthine dehydrogenase, putative  65.73 
 
 		 780 aa  1004    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3661  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  53.5 
 
 		 792 aa  794    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3760  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  56.6 
 
 		 764 aa  780    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2041  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.39 
 
 		 787 aa  788    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1814  xanthine dehydrogenase  54.16 
 
 		 839 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3947  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  53.1 
 
 		 825 aa  776    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0952887 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2421  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.37 
 
 		 785 aa  860    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2426  xanthine oxidase  57.14 
 
 		 793 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511949  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1454  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  48.43 
 
 		 772 aa  638    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3213  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.52 
 
 		 787 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1796  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.83 
 
 		 797 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.246006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3719  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  60.18 
 
 		 779 aa  891    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3555  xanthine oxidase  52.98 
 
 		 825 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3925  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  56.86 
 
 		 784 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1923  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.6 
 
 		 788 aa  871    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1589  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.29 
 
 		 799 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.589614  normal  0.979072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1409  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.52 
 
 		 787 aa  792    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.836704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3238  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.98 
 
 		 825 aa  773    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0452  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  64.91 
 
 		 784 aa  1003    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3461  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.24 
 
 		 787 aa  819    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.222432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3843  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  54.29 
 
 		 799 aa  804    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303444  normal  0.626231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02516  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  50.07 
 
 		 788 aa  714    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0936  xanthine oxidase  50.49 
 
 		 812 aa  751    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2752  xanthine oxidase  53.75 
 
 		 798 aa  801    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988781  normal  0.624971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3042  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.2 
 
 		 800 aa  794    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.0190661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0798  xanthine oxidase  55.31 
 
 		 830 aa  756    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1154  xanthine dehydrogenase  55.96 
 
 		 812 aa  781    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5909  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.63 
 
 		 808 aa  809    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4498  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  100 
 
 		 785 aa  1607    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.736766  normal  0.0805913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1480  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  52.85 
 
 		 801 aa  730    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2706  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.39 
 
 		 787 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.970809  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0949  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  55.25 
 
 		 802 aa  802    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.420397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3885  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  54.45 
 
 		 788 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4621  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  73.21 
 
 		 777 aa  1147    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1788  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  55.01 
 
 		 797 aa  769    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3810  xanthine dehydrogenase  55.35 
 
 		 799 aa  818    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1141  xanthine dehydrogenase  51.91 
 
 		 856 aa  781    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.864044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0892  xanthine oxidase  56.95 
 
 		 783 aa  832    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0579725  normal  0.529088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0794  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.03 
 
 		 788 aa  834    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0498  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein / xanthine oxidase  53.47 
 
 		 782 aa  771    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2705  xanthine oxidase / xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  69.53 
 
 		 777 aa  1115    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.233827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0349  xanthine dehydrogenase  57.11 
 
 		 787 aa  847    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.430074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3198  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.52 
 
 		 787 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5001  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  54.17 
 
 		 828 aa  746    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0225  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  62.19 
 
 		 793 aa  922    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.467704  normal  0.0688088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2425  xanthine dehydrogenase  51.49 
 
 		 784 aa  780    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0872  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.39 
 
 		 787 aa  788    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.208444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0712  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  56.38 
 
 		 818 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2959  xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit  57.46 
 
 		 781 aa  860    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0461211 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3321  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  73.58 
 
 		 781 aa  1169    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.98232  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2834  xanthine oxidase  71.36 
 
 		 781 aa  1116    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.266912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0712  xanthine dehydrogenase  57.33 
 
 		 787 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44740  xanthine dehydrogenase  55.61 
 
 		 799 aa  823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0454132 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0833  hypothetical protein  57.37 
 
 		 787 aa  851    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0805  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.24 
 
 		 787 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3605  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  55.22 
 
 		 799 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.82083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3103  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  52.37 
 
 		 801 aa  757    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4258  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  66.97 
 
 		 770 aa  1054    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.933602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3159  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.52 
 
 		 787 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2449  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  52.5 
 
 		 801 aa  761    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2551  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.2 
 
 		 784 aa  837    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.985058 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0859  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  58.74 
 
 		 794 aa  918    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0729  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  57.33 
 
 		 787 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1904  xanthine dehydrogenase, C-terminal subunit  58.39 
 
 		 787 aa  788    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.496963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2698  xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit  53.46 
 
 		 779 aa  786    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1789  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  47.7 
 
 		 767 aa  649    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.65016  normal  0.238087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1129  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  53.62 
 
 		 823 aa  736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.818016  normal  0.268522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1034  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  53.06 
 
 		 799 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0974442  normal  0.558383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3135  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  76.06 
 
 		 779 aa  1192    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2604  xanthine dehydrogenase  46.69 
 
 		 800 aa  625  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0258  xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding subunit  46.55 
 
 		 804 aa  592  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1637  xanthine oxidase  46.98 
 
 		 767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  42.56 
 
 		 1350 aa  537  1e-151  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6766  Xanthine dehydrogenase  41.16 
 
 		 769 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  39.9 
 
 		 1363 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  37.21 
 
 		 1387 aa  456  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1732  xanthine dehydrogenase  31.03 
 
 		 730 aa  315  9.999999999999999e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1730  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.26 
 
 		 754 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.142729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1446  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.02 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5971  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  28.91 
 
 		 715 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.848912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3076  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.93 
 
 		 757 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.346881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1135  hypothetical protein  25.78 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423921  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1504  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  27.84 
 
 		 758 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1642  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  29.86 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0432  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  27.98 
 
 		 753 aa  228  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4003  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.05 
 
 		 772 aa  225  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.567509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1247  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  30.47 
 
 		 914 aa  222  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.265389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1817  hypothetical protein  27.85 
 
 		 766 aa  221  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5751  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.16 
 
 		 940 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.373125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2136  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  28.27 
 
 		 768 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2657  selenium-dependent molybdenum hydroxylase 1  27.64 
 
 		 856 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>