19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1264 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1264  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  544  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1314  hypothetical protein  97.5 
 
 		 135 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.550477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2086  hypothetical protein  97.5 
 
 		 135 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1268  hypothetical protein  97.92 
 
 		 219 aa  92.4  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.96565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0631  hypothetical protein  46.6 
 
 		 137 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3157  hypothetical protein  38.76 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  70.21 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2991  hypothetical protein  38.3 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3393  hypothetical protein  32.23 
 
 		 132 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.000000765779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3436  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  73.68 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1352  hypothetical protein  35.64 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4042  hypothetical protein  32 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5697  hypothetical protein  39.42 
 
 		 136 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2088  hypothetical protein  34.31 
 
 		 132 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0170245  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1875  hypothetical protein  28.16 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  50 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1642  hypothetical protein  26.21 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  47.73 
 
 		 268 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>